آزمایشگاه مرکز در طبقه 1 واقع گردیده است و با تجهیز به دستگاه‌های Sysmex  ، اتوآنالایزر BT1500 و سدیمان آنالایزر، قابلیت انجام آزمایش‌های تخصصی و فوق‌تخصصی را در بخش‌های هماتولوژی، بیوشیمی، سرولوژی، هورمون‌شناسی، تومورمارکر، میکروب‌شناسی، آنالیز ادرار و انگل‌شناسی دارا می‌باشد.